Grupa Patomorfologiczna przeanalizowała wypracowane przez Grupę Kliniczną algorytmy postępowania. Grupa wypracowując swoje schematy opierała się na wytycznych zagranicznych m.in. na algorytmie brytyjskim, gdzie w sposób bardzo prosty ujęta została kaskadowość badań w poszczególnych przypadkach. Grupa ustaliła, że w celu uzyskania najlepszego materiału do badań patomorfologicznych, immunohistochemicznych jak i biologii molekularnej, jest potrzeba stałej edukacji w precyzyjnym pobraniu i przygotowaniu materiału do badań (odpowiednie stężenie formaliny, czas utrwalania, temperatura, przecięcie dużych materiałów…). Konkretne wytyczne są już spisane znajdą się w opracowaniu Grupy.
